中华鳖3个地理群体线粒体基因D-loop区遗传多样性分析 The genetic diversity of mitochondrial DNA D-loop

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eDY4fAv-|c0ln0摘要:采用PCR结合DNA测序技术和SSCP技术,分析了中华鳖3个地理群体线粒体DNA(mtDNA) D-loop区部分序列的变异及遗传多样性.在25个个体中,其碱基组成为A+T的平均含量(65.4%)高于G+C(34.6%),共检测到变异位点7个(约占总位点数的5.7%),转换/颠换值为2.76.核苷酸多样性(π)为0.019 95,平均核苷酸差异数(K)为2.453.25个个体分属6个单倍型,单倍型多样度(Hd)为0.707,单倍型间的平均遗传距离(P)为0.027.6个单倍型构建的UPGMA系统树聚为3个分支.结果表明,中华鳖群体mtDNA D-loop区序列存在着较丰富的变异和遗传多样性,日本鳖的遗传多样性比黄河鳖和黄沙鳖丰富,黄沙鳖与日本鳖、黄河鳖的遗传距离较远.而且PCR-SSCP可以检测到两种类型的电泳图谱,其中Ⅱ型均为日本鳖,该技术可用于78位TT←→AA颠换变异位点的检测.

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