日本沼虾微卫星引物筛选及群体遗传多样性分析 Isolation and genetic diversity analysis of microsatellit

排行榜 收藏 打印 发给朋友 举报 来源: 《水产学报》 发布者:cjk3d
热度12票 浏览8次 【共0条评论】【我要评论 时间:2012年8月14日 16:15
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摘要:采用(CI)15、(CA)15两种生物素标记及磁珠富集法构建了太湖日本沼虾基因组微卫星富集文库.120个微卫星克隆中83个位点的核心序列重复在10个以上,长度介于191~580 bp,平均为311 bp;重复类型中,(CA/GT)n及(AG/TC)n分别占59.09%及20.45%,还检测到(GC)n(AAG)n、(ACAA)n和(GGCAGA)n等17种类型,包括25.75%完美型,20.45%非完美型和53.80%复合性.用其中12条微卫星引物扩增吴江、滨湖、宜兴和吴兴4个群体240个个体的基因组DNA,各位点表现出较高的遗传多样性,除Mni86、Mni103和Mni114外,其它群体位点大都表现出显著的杂合子缺失,4个群体的遗传分化为低度分化(FST<0.05),4个群体中97.58%遗传变异存在于群体内,仅有2.42%的遗传变异来自于群体之间;吴江和吴兴群体亲缘关系最近,与宜兴和滨湖群体亲缘关系渐远.水利论文v!`Y-@8MTSP

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冯建彬[1] 马克异[2] 李家乐[3] 华雪铭[2] 丁怀宇[4]水利论文$xaG!rcF

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g`:dnp Z u0上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室,上海,201306;淮阴师范学院江苏省环洪泽湖生态农业生物技术重点实验室,江苏,淮安,223300上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室,上海,201306上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室,上海,201306;上海市高校水产养殖学E研究院,上海海洋大学水产与生命学院,上海,201306淮阴师范学院江苏省环洪泽湖生态农业生物技术重点实验室,江苏,淮安,223300水利论文TE _TZ'd

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日本沼虾 微卫星引物扩增 引物筛选 群体 遗传多样性分析 microsatellite DNA analysis 遗传变异 亲缘关系 微卫星富集文库 位点 基因组 杂合子缺失 生物素标记 磁珠富集法 遗传分化 宜兴 吴江 核心序列 滨湖

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江苏省苏北科技发展计划项目,江苏省环洪泽湖生态农业生物技术重点实验室开放课题,上海海洋大学博士科研启动基金,上海市科委重点科技攻关计划项目,上海市重点学科建设项目

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日本沼虾微卫星引物筛选及群体遗传多样性分析

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