武汉东湖浮游生物宏基因组与环境重金属的关系 Relationships between metagenome of plankton community an

排行榜 收藏 打印 发给朋友 举报 来源: 《中国环境科学》 发布者:cjk3d
热度38票 浏览13次 【共2条评论】【我要评论 时间:2010年6月19日 14:46
武汉东湖浮游生物宏基因组与环境重金属的关系

Relationships between metagenome of plankton community and heavy metals in Lake Donghu, Wuhan

采用针对16SrRNA和18SrRNA基因的引物,对武汉东湖不同营养水平湖区的浮游生物宏基因组进行凝胶电泳分析(PCR-DGGE)的指纹分析,并探讨宏基因组与环境重金属的关系.结粜表明,PCR-DGGE分析共获得82条谱带,其多态率为82.9%,特有谱带占31.7%.Ⅰ-Ⅴ站点的谱带分别为36,34,44,50,56条.5个站点浮游生物群落PCR-DGGE指纹结构的聚类分析(UPGMA)分成两大类:Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ站为一类,Ⅳ、Ⅴ站为一类,这与重金属(铅、铬、汞、镉、砷、铜)浓度对各站点的聚类分枝关系相一致.相关分析显示,变性梯度凝胶电泳(DGGE)谱带所代表的分类单元数(OTUs)与镉、铬的浓度存在较明显的相关性,其相关系数分别为-0.942(P<0.05)和-0.928(P<0.05).

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作 者: 颜庆云 余育和 冯伟松  
作者单位:中国科学院水生生物研究所,水生生物多样性与保护重点实验室,湖北武汉,430072 
刊 名:中国环境科学  ISTIC PKU
英文刊名:CHINA ENVIRONMENTAL SCIENCE 
年,卷(期):2010 30(z1) 
分类号:X835 
关键词:浮游生物群落   宏基因组   变性梯度凝胶电泳(DGGE)   重金属   plankton community   metagenome   DGGE   heavy metals  
机标关键词:武汉东湖浮游生物宏基因组环境重金属相关系数PCR-DGGE分析谱带变性梯度凝胶电泳站点凝胶电泳分析不同营养水平18SrRNA基因指纹分析相关分析生物群落浓度聚类分析16SrRNA单元数UPGMA 
基金项目:国家自然科学基金资助项目,淡水生态与生物技术国家重点实验室开放课题 
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